Seleksi perpindahan murid dilaksanakan melalui tes akademik dan wawancara .Di SMAN 88 Jakarta materi seleksi akademik untuk kelas X terdiri dari : - Matematika, IPA, IPS Bahasa Indonesia,Bahasa Inggris Kelas XI: - Matematika,Bahasa Indonesia,Bahasa Inggris ,Fisika,Biologi, Geografi. - Matematika,Bahasa Indonesia,Bahasa Inggris , Ekonomi,Sosiologi , Geografi. Proses wawancara kepada peserta seleksi bertujuan memastikan kecocokan murid dengan lingkungan sekolah baru, menggali potensi akademis maupun non-akademis, dan membangun komunikasi awal yang baik antara sekolah dan murid. Seleksi berjalan lancar dan tertib.